Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM187BQ17R55 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms