Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDO1Q16878 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms