Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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RTN1Q16799 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RTN1Q16799 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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