Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CNGA3Q16281 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CNGA3Q16281 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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CNGA3Q16281 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNGA3Q16281 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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