Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC6Q16204 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC6Q16204 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC6Q16204 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CCDC6Q16204 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC6Q16204 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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