Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ANKRD1Q15327 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD1Q15327 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms