Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSPNQ14714 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms