Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CBFBQ13951 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBFBQ13951 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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