Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC009075.2-201ENST00000568483 301 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 Z98949.1-208ENST00000597614 816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 RBBP4P3-201ENST00000619705 1283 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MKRN4PQ13434 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms