Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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