Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM2Q13029 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRDM2Q13029 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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