Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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FOXD4Q12950 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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