Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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PTPN13Q12923 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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