Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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STX4Q12846 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
STX4Q12846 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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