Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms