Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SYCNQ0VAF6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms