Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CXCL9Q07325 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms