Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC078899.4-201ENST00000593952 1113 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 CSRP3-202ENST00000533783 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TNP2Q05952 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CYP2C19-201ENST00000371321 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 FGF1-206ENST00000407758 759 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMEM267-204ENST00000510130 721 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TNP2Q05952 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms