Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHRNB3Q05901 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms