Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUCB1Q02818 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms