Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IRF8Q02556 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms