Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
OC90Q02509 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms