Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDR2Q01850 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDR2Q01850 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms