Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1DQ01668 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms