Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MDM2Q00987 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms