Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK16Q00536 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK16Q00536 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK16Q00536 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms