Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAD3P84022 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAD3P84022 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms