Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
RPS29P62273 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
RPS29P62273 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms