Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SIK1P57059 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms