Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms