Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PGGT1BP53609 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP53609 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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