Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARL4AP40617 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms