Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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