Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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