Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KB1P23443 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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