Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA6P23229 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms