Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CA4P22748 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CA4P22748 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms