Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LMNB1P20700 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms