Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GM2AP17900 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GM2AP17900 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GM2AP17900 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GM2AP17900 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms