Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMPD1P17405 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms