Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAV1P15498 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAV1P15498 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms