Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB1P14653 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FCRLA-203ENST00000309691 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL590408.1-201ENST00000430905 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB1P14653 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms