Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP2AP11388 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP2AP11388 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms