Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HMBSP08397 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HMBSP08397 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms