Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms