Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF208O43345 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms