Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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TMED7Q9Y3B3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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