Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTNAP2Q9UHC6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms