Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CGGBP1Q9UFW8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms