Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms